第99回全国高校ラグビー大会は12月30日、雨の東大阪市花園ラグビー場で2回戦がおこなわれ、シード校が登場。午前中には、御所実業（奈良）、日本航空石川（石川）、佐賀工業（佐賀）、中部大春日丘（愛知）などが勝って3回戦進出を決めた。
春の全国選抜大会で準優勝だったAシードの御所実は朝明（三重）と対戦し、79－0と圧倒。
前半3分にキックパスから先制すると、5分にはカウンターでWTB須股草太のビッグゲインからチャンスとなり、つないでFB石岡玲英がフィニッシュ。9分にはPR島田彪雅がディフェンス裏にボールを蹴り、さらにWTB須股が巧みに足でコントロールし、連続トライとなった。12分にはFB石岡が躍動して自陣から60メートル以上走り切り、点差を拡大。御所実のアタックはテンポが速く、ターンオーバーからの切り返しが光り、力強いドライビングモールも見せた。
Bシードの日本航空石川は城東（徳島）と対戦し、39－0で快勝した。
前半21分、日本航空石川はターンオーバーから攻め込み、キック＆チェイスでボールを確保したCTB大村亮介が先制。23分にはFL青柿研児がハーフウェイから抜けて走り切った。後半は、モールから持ち出したNO8パトリック・ヴァカタがインゴールに突っ込むなど4トライを追加し、城東を退けた。
Bシードの佐賀工は若狭東（福井）とぶつかり、97－0と大勝した。
主将のCTB三良煕三郎や、元日本代表FB立川剛士さんの息子であるSO立川大輝などが鮮やかな走りを披露。FWもNO8石川空悟などボールキャリーの強い選手が多く、スクラムでもプレッシャーをかけ得点につなげた。後半にはラインアウトスチールから強力なドライビングモールで得点するなど、安定したセットピースを活かした。
Bシードの中部大春日丘は札幌山の手（南北海道）と対戦し、19－0で競り勝った。
開始早々、FL吉田柊也がキックチャージから先制。札幌山の手も奮闘し接戦となったが、中部大春日丘は7－0で迎えた後半10分、敵陣22メートルライン手前のスクラムからボールをもらったSH宮坂航生が軽快なステップとスピードで一気にゴールに迫り、FWがパワープレーで得点。18分にはモールを形成しロングドライブで敵陣深くに入り、密集から抜けたCTB笠井将英がフィニッシュし勝利を引き寄せた。